Le pôle Gest’Aqua publie son premier data paper*, fruit de 24 années de recueil de données uniques en leur genre

Connaissances
Publications - vidéos

Publié dans le Biodiversity Data Journal par le pôle de recherche et développement AFB-Inra Gest’Aqua, cet article présente un jeu de données sur le suivi de jeunes saumons atlantiques (Salmo salar), espèce migratrice.

> Consultez l'article (en anglais)

Le saumon atlantique, espèce en déclin

Protégé par la convention de Berne et par la directive européenne sur les habitats, il a été classé comme vulnérable sur la liste rouge française de l'UICN. Le déclin du saumon est le résultat de causes combinées et cumulées, principalement anthropiques : changement climatique, rupture de la continuité écologique, dégradation de la qualité de l'eau et de l'habitat et surexploitation par les pêcheries.

*Data paper : publication qui décrit un jeu de données scientifiques brutes (data, dataset), notamment à l’aide d’informations précises, appelées
métadonnées (metadata).
(Source : CoopIST-Cirad)

Un jeu de données aux multiples atouts

Depuis 24 ans, un protocole de pêche électrique spécifique et standardisé a été utilisé pour cibler les jeunes saumons atlantiques et recueillir les données diffusées lors de la publication de ce data paper.

L'ensemble de données mis à disposition comprend actuellement 47 077 points de données d'occurrence provenant de 105 sites couvrant jusqu'à 24 ans dans trois bassins versants différents en France. Au-delà du projet destiné à la gestion du stock, il a une utilité pour la recherche puisqu'il associe des mesures d'abondance à la mesure de traits biologiques et à la collecte d'échantillons de tissus. Il permet la caractérisation actuelle et rétrospective des individus ou des populations (croissance, maturité précoce, survie), en fonction des traits d'histoire de vie et des caractéristiques génétiques, en relation avec les changements des conditions environnementales.

Le fait que la surveillance ait lieu en France, qui est la partie sud de la zone de distribution de cette espèce, rend les données particulièrement pertinentes pour les études sur le changement climatique.

Une politique de partage des données

L’étude des poissons migrateurs circulant entre eau douce et marine est l’une des principales missions du pôle de recherche et développement AFB-Inra Gest’Aqua créé en 2013. Il mène des recherches et conduit avec ses partenaires, liés à la gestion, quatre observatoires à long terme sur les migrateurs et leur environnement depuis plusieurs décennies. Gest’Aqua est engagé dans une politique de mise à disposition des données, qui sont uniques en France par leur profondeur temporelle et leur complémentarité, à la fois pour le monde de la recherche et de la gestion.

Les données des observatoires long terme du pôle sont progressivement intégrées au site du GBIF (système mondial d’information sur la biodiversité). D’ores et déjà les données du data paper peuvent y être retrouvées :

Zoom méthode

Les protocoles de pêche à l’électricité en question lors du colloque « Échantillonnage à l’électricité : de l’objectif aux réglages » (novembre 2017)

Organisé par l’Inra et l’AFB, ce colloque a été l'occasion d'échanger autour des connaissances actuelles concernant les aspects techniques (engins, protocoles) et administratifs (normes et accréditations) liés à la pêche à l’électricité. Il a permis ainsi de faire un état des lieux sur les pratiques et les connaissances en France, et en particulier sur les résultats issus de l’action sur les dispositifs et réglages portée dans le cadre du pôle AFB-Inra Gest’Aqua.

Une centaine de professionnels liés à la pêche électrique étaient présents, venant divers horizons (bureaux d’études, fédérations et associations agréées pour la pêche et la protection du milieu aquatique, autres associations, organismes publics et constructeurs d’engins de pêche).